Après avoir vérifié et revérifié mon code, je continuais à avoir le problème suivant
Unable to load transpiler to transpile http://localhost:3000/app/common/bla.js
Error loading http://localhost:3000/app/common/bla.js as "./common/bla" from http://localhost:3000/app/app.module.js
Error loading http://localhost:3000/app/common/bla.js as "./common/bla" from http://localhost:3000/app/app.module.js
Sur Google, je tombe sur le cas d'un autre développeur qui a remarqué que du code qu'il avait commenté provoquait une transpilation indésirable par SystemJS.
Bingo, j'avais moi aussi essayé une alternative à du code qui marchait et avais simplement commenté ma solution initiale le temps de voir si la solution alternative serait plus appropriée.
Conclusion : SystemJS essaie de transpiler le code commenté. Supprimez donc votre code commenté ou bien utilisez des "meta" dans systemjs.config.js. J'ai opté pour la solution la plus simple consistant à supprimer mes commentaires.
Lien vers le post qui m'avait mis sur la bonne voie.